Melanotan II je sintetični analog -melanocite-stimulirajočega hormona (-MSH), ki je peptidni hormon.

Za metodo sinteze v trdni{0}}fazi za Melanotan II so značilni naslednji koraki: najprej uporaba Fmoc-linker-aminometilne smole kot nosilca; nato zaporedno spajanje aminokislin v skladu s Fmoc/tBu trdno{3}}fazno sintezno metodo peptida in izvajanje acetilacije; nato odstranitev trifluoroacetilnih in metilestrskih skupin iz aminokislin s hidrolizo z uporabo 1–2 N raztopine NaOH in dioksana (z volumskim razmerjem NaOH proti dioksanu v območju od 1:1 do 1:4); nato izvajanje ciklizacije neposredno na smoli z uporabo kondenzacijskega sredstva; in končno, cepitev peptida iz smole z uporabo zmesi trifluoroocetne kisline, vode, tioanizola in 1,2-etanditiola v razmerju 92,5:2,5:2,5:2,5. Nastali surovi Melanotan II se očisti in pretvori v acetatno sol s preparativno HPLC, čemur sledi-sušenje z zamrzovanjem, da dobimo Melanotan II acetat. Uporabljene aminokisline vključujejo Fmoc-Lys(Tfa)-OH, Fmoc-Trp(Boc)-OH, Fmoc-Arg(Pbf)-OH, Fmoc-D-Phe-OH, Fmoc-His(Trt)-OH, Fmoc-Asp(OMe)-OH in Fmoc-Nle-OH.